Oorspronkelijk had Jan zijn eigen swingorkest, en werkte hij onder meer met Jan Leyers. Hij startte zijn eigen septet en werd hiermee laureaat van de Jazz Hoeilaart international contest. Het Jan Muës Septet (later the Musetrap) nam, een paar jaar later, de welgesmaakte CD album Mystic Smile op. Vanaf 1987 zien we Jan op internationale Jazzpodia: AUDI Jazz, Jazz Middelheim, Brosella Folk & Jazz, 'De Brakke Grond' in Amsterdam, 'De Doelen' in Rotterdam, Christal Jazz night, Milano Jazz Festival, Cambridge Festival, Madrid SAP meeting, Jazz in't Park…
Jan is gast in diverse VRT radio - en televisieprogramma's waaronder Fred Brouwers' Lange Mars, Passage, Jazzcafé, Week van Radio 3, Eenhoorn, So What en De Zevende Dag.
Bovendien wordt in 1992 het 'Jan Muës Quartet' cultureel ambassadeur om de stad Antwerpen te vertegenwoordigen op de wereldexpo in Sevilla.
Jan werkte ook als freelance trompettist in de toenmalige BRT- bigband en schreef arrangementen voor de bigband. Hij was jarenlang de vaste solist van François Glorieux.
Hij werd docent aan de jazzacademie in Overijse en gaf tal van clinics en workshops in Dworp, Brugge en het Brusselse conservatorium.
In 1997 ontving hij de vijfjaarlijkse SABAM - prijs voor zijn bijdrage tot de Belgische muziek in. Hij had tevens een radio 1 hit met 'Cross the Channel'. In 2004 startte Jan op uitnodiging van KLARA het "Tribute To Baker" project. Jan is één van de weinigen die de muziek van Chet zowel instrumentaal als vocaal perfect weet neer te zetten.
Emotioneel juist en technisch perfect, en toch herkenbaar Jan Muës. Het succes van dit project heeft geleid tot het project Cool Cargo.
Jan was tot 1 juli 2005 verbonden aan de The Rhythm Junks, de groep rond Steven De Bruyn, en werkte mee aan de CD opnames ‘Virus 23'. Hij kiest er voor om voluit te gaan voor "Cool Cargo" en sessiewerk!
Tot slot is Jan een getalenteerde schilder. In 1997 verscheen een uitgave met zijn schilderijen. "De Koning te rijk". Marc Van den Hoof schreef bij elk werk passende poëzie. (uitgeverij.P)
Jan is ook actief als acteur / regisseur van zijn theater - en filmproject "Spionaise".Hiermee trekt hij langs de Vlaamse culturele centra's. Bovendien realiseert hij kortfilms.
